莫利萨
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doi：10.18129/b9.bioc.monalisa
bined主题富集分析和可视化
生物导体版本：版本（3.15）
在基因组学数据分析中与序列基序一起使用的有用功能。这些包括用预测的基序命中的注释基因组区域或序列的方法，并确定驱动观察到可访问性或表达变化的基序。还提供了为获得结果提供信息可视化的功能。
作者：Dania Machlab [AUT]
，Lukas Burger [AUT]，夏洛特·索森（Charlotte Soneson）[aut]，迈克尔·斯塔德（Michael Stadler）[AUT，CRE]
维护者：迈克尔·斯塔德勒（Michael Stadler）<迈克尔·斯塔德勒
引用（从r内，输入引用（“ Monalisa”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Monalisa”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Monalisa”）
| html | R脚本 | Monalisa-丽莎的基序分析 |
| html | R脚本 | selecting_motifs_with_randlassostabsel |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.14（R-4.1）（0.5岁） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | R（> = 4.1） |
| 进口 | 方法，统计，UTILS，GRDEVICES，图形，生物基因，，，，基因组机，，，，TFBSTOOLS，，，，生物弦，，，，iranges，，，，刺，，，，BSGENOME，，，，Glmnet，，，，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，生物比较， 网格，循环，，，，复杂的图像（> = 2.11.1），xvector，，，，GenomeInfodB， 工具，vioplot |
| 链接 | |
| 建议 | Jaspar2020，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，生物使用，，，，栅格 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/fmicompbio/monalisa//www.anjoumacpherson.com/packages/monalisa/https://fmicompbio.github.io/monalisa/ |
| BugReports | https://github.com/fmicompbio/monalisa/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | monalisa_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | monalisa_1.2.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | monalisa_1.2.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/monalisa |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/monalisa |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/monalisa/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
