雾气

doi：10.18129/b9.bioc.mistyr

多视线间空间建模框架

生物导体版本：版本（3.15）

MIST MIST是多视线间空间建模框架（MISTY）的实现。Misty是一个可解释的机器学习框架，用于知识提取和分析单细胞，高度多路复用，空间解析的数据。Misty通过分析细胞内和细胞间关系来促进对标记相互作用的深入了解。Misty是一个灵活的框架，能够处理自定义的视图数量。这些观点中的每一个都可以描述不同的空间上下文，即定义标记的表达式之间的关系，例如细胞内调节或旁分泌调节，但此视图还可以捕获细胞类型的特定关系，捕获功能性关系，足迹或专注于不同解剖区域之间的关系。每个薄雾视图都被认为是测量标记表达式中可变性的潜在来源。然后，分析了每种薄雾视图对每个标记的总表达的贡献，并根据与导致观察到的贡献的其他测量值的相互作用进行解释。

作者：Jovan Tanevski [Cre，Aut]，Ricardo Omar Ramirez Flores [CTB]，PhilippSchäfer[CTB]

维护者：jovan tanevski

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ MISTYR”）

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文档

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browsevignettes（“ mist mistr”）

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细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.0）
进口	断言，，，，商在，，，，Deldir，，，，消化，，，，距离，，，，dplyr，，，，Filelock，，，，Furrr（> = 0.2.0），GGPLOT2， 方法，purrr，，，，游侠，，，，readr，，，，岭，，，，rlang，，，，rlist，，，，r.utils，统计Stringr，，，，蒂布尔，，，，花花公子，utils，用
链接
建议	生物使用，，，，COVR，，，，未来，，，，Igraph（> = 1.2.7），尼特，，，，大量的，，，，rmarkDown，，，，测试（> = 3.0.0）
系统要求
增强
URL	https://saezlab.github.io/mistyr/
BugReports	https://github.com/saezlab/mistyr/issues
取决于我
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包装档案

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源包	mistyr_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	mistyr_1.4.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	mistyr_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mistyr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/薄雾
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/mistyr/
软件包下载报告	下载统计