甲基小姐

doi：10.18129/b9.bioc.missmethyl

分析Illumina人甲基化Beadchip数据

生物导体版本：版本（3.13）

归一化，测试差异性变异性以及差异甲基化以及基因集测试来自Illumina Infinium humbhymethylation阵列的数据。归一化过程是阵列内归一化（SWAN）的子集量子，它允许单个阵列上的Infinium I和II类型探针一起进行归一化。差异性可变性的测试基于莱文测试的经验贝叶斯版本。使用RUV进行差异甲基化测试，该测试可以通过使用阴性对照探针在高维数据中调整未知来源的系统误差。基因本体分析是通过考虑阵列上每个基因的探针的数量来进行的，并考虑了多基因相关的探针。

作者：Belinda Phipson和Jovana Maksimovic

维护人员：belinda phipson ，jovana maksimovic ，安德鲁·朗斯代尔（Andrew Lonsdale）

安装

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if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ missmethyl”）

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文档

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html	R脚本	甲基小姐：分析Illumina人甲基化Beadchip数据
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细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.26.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（6。5年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 3.6.0），Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19，，，，Illuminahumanmethylationepicanno.ILM10B4.HG19
进口	AnnotationDbi，，，，偏见，，，，生物酶，，，，生物基因，，，，基因组机，，，，go.db，，，，Illuminahumanmethylation450Kmanifest，，，，光照明甲基甲基化epicmanifest，，，，iranges，，，，林玛， 方法，甲基菌，，，，Minfi，，，，org.hs.eg.db，，，，鲁夫，，，，S4VECTORS，，，，Statmod，，，，Stringr，，，，总结性特征
链接
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系统要求
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源包	Missmethyl_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	Missmethyl_1.26.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Missmethyl_1.26.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/missmethyl
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/missmethyl
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/missmethyl/
软件包下载报告	下载统计