Minfi.

DOI：10.18129 / b9.bioc.minfi.

分析Illumina Infinium DNA甲基化阵列

Biocometiond版本：释放（3.12）

分析和可视化Illumina Infinium甲基化阵列的工具。

作者：Kasper Daniel Hansen [Cre，Aut]，Martin Ariee [Aut]，Rafael A. Irtizarry [Aut]，Andrew E. Jaffe [CTB]，Jovana Maksimovic [CTB]，E. Andres Houseman [CTB]，Jean-PhilippeFortin [CTB]，Tim Triche [CTB]，Shan V. Andrews [CTB]，Peter F. Hickey [CTB]

维护者：Kasper Daniel Hansen

安装

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版本	1.36.0
在生物导体中以来	BIOC 2.9（R-2.14）（9.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	方法，生物根系（> = 0.15.3），Genomicranges.那概括分析（> = 1.1.6），生物仪器那Bumphunter.（> = 1.1.9）
进口	S4Vectors.那Genomeinfodb.那BioBase.（> = 2.33.2），绞喉那伯普兰那rcolorbrewer.那格子那nor1mix.那siggenes.那林马那预处理核那Illuminaio.（> = 0.23.2），delayedmatrixstats（> = 1.3.4），蒙链那Genefilter.那nlme.那重塑那大量的那Quadprog.那data.table.那地理曲线，统计，grdevices，图形，utils，delayedarray（> = 0.15.16），HDF5Array.那生物相投
链接到
建议	Illuminahumanmethylation450kmanifest.（> = 0.2.0），illuminahumanmethylation450ka​​nno.ilmn12.hg19（> = 0.2.1），minfidata.（> = 0.18.0），minfidatapic.那flowsorted.blood.450k.（> = 1.0.1），运行那消化那生物焦那kn那RAMAMAMDOW.， 工具
系统要求
加强
URL.	https://github.com/hansenlab/minfi.
Bugreports.	https://github.com/hansenlab/minfi/issues.
取决于我	大梅隆那冠军那Compartmap.那骗子那dmrcate.那flowsorted.blood.450k.那flowsorted.blood.epic.那flowsorted.Cordblood.450K.那flowsorted.CordbloodCombined.450K.那flowsorted.cordbloodnorway.450k.那flowsorted.dlpfc.450k.那illuminahumanmethylation27kanno.ilmn12.hg19.那illuminahumanmethylation27kmanifest那illuminahumanmethylation450ka​​nno.ilmn12.hg19那Illuminahumanmethylation450kmanifest.那illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19.那illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b3.hg19.那illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b4.hg19.那IlluminahumanMethationPicmanifest.那甲基疗法arrayAlysis.那弥撒那Methyvimdata.那minfidata.那minfidatapic.那重新那sh
进口我	enmcb.那enmix.那Funtoonorm.那一顿饭那肉那METHYLAID.那Methylcc.那弥撒那Methyvim.那MissMethyl.那Quantro.那彻底甲基化那Skewr.
建议我	Bradata.那Copyneutralima.那Epivizr.那Epivizrchart.那哈曼那McSea.那多atAdataset.那rnbeads.那芝麻
链接给我
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源包	minfi_1.36.0.tar.gz.
Windows二进制文件	minfi_1.36.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	minfi_1.36.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/minfi.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ minfi
包短网址	https://biocumon.org/packages/minfi/
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