miloR

DOI:10.18129 / B9.bioc.miloR

微分附近丰富测试图

Bioconductor版本:版本(3.13)

这个包执行单细胞微分丰富测试。细胞状态模拟代表社区近邻图。假设检验执行使用负二项式广义线性模型。

作者:艾玛·迈克•摩根(aut (cre)丹(aut,施莱)

维护人员:迈克摩根<迈克尔。摩根在cruk.cam.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“miloR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“miloR”)

HTML	R脚本	微分与米洛丰度测试
HTML	R脚本	微分与米洛丰富测试——鼠标原肠胚形成的例子
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文本		许可证

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 4.0.0),刨边机
进口	BiocNeighbors,SingleCellExperiment,矩阵(1.3 > = 0),S4Vectors统计数据,stringr、方法、igraph,irlba,cowplot,BiocParallel,BiocSingular,limma,ggplot2,宠物猫,matrixStats,ggraph,gtools,SummarizedExperiment,拼接而成,tidyr,dplyr,ggrepel,ggbeeswarm,RColorBrewer,grDevices
链接
建议	testthat,质量,mvtnorm,嘘,食物,covr,knitr,rmarkdown,uwot,BiocStyle,MouseGastrulationData,魔法,RCurl,旋度、图形
SystemRequirements
增强了
URL	https://marionilab.github.io/miloR
BugReports	https://github.com/MarioniLab/miloR/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	miloR_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	miloR_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	miloR_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miloR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miloR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/miloR/
包下载报告	下载数据