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- Bioconductor 3.16
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miaSim
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DOI:10.18129 / B9.bioc.miaSim
微生物组数据模拟
Bioconductor版本:版本(3.16)
微生物与广义生态模型时间序列模拟自发形成的不稳定(SOI),和其他模型。哈贝尔的中性模型用于确定丰度矩阵。由此产生的大量矩阵应用于SummarizedExperiment或TreeSummarizedExperiment对象。
作者:Karoline浮士德(aut),余高(aut),艾玛Gheysen (aut),丹尼尔·里奥斯加尔萨(aut) Yagmur姆塞克(cre, aut),狮子座拉赫蒂(aut)
维护人员:Yagmur西姆西可< Yagmur。西姆西可在hsrw.org >
从内部引用(R,回车引用(“miaSim”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“miaSim”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“miaSim”)
| HTML | R脚本 | miaSim |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.14 (r - 4.1)(1年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |文件许可证 |
| 取决于 | SummarizedExperiment,TreeSummarizedExperiment |
| 进口 | deSolve统计数据,poweRlaw,gtools,S4Vectors,MatrixGenerics |
| 链接 | |
| 建议 | rmarkdown,knitr,BiocStyle,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/microbiome/miaSim |
| BugReports | https://github.com/microbiome/miaSim/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | miaSim_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | miaSim_1.4.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | miaSim_1.4.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | miaSim_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miaSim |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miaSim |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/miaSim/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/miaSim/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
