miRmine

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRmine

数据包与miRmine数据库中的miRNA-seq数据集作为rangedsummarizeexperiment

Bioconductor版本:Release (3.15)

miRmine数据库是来自不同公开的miRNA-seq数据集的表达配置文件的集合,Panwar等人(2017)miRmine: a database of Human miRNA expression,使用此数据包作为rangedsummarizeexperiment准备。

作者:Dusan Randjelovic [aut, cre]

维护者:Dusan Randjelovic < Dusan。Randjelovic在sbgenomics.com>

引文(从R内,输入引用(“miRmine”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“miRmine”)

超文本标记语言 R脚本 miRmine
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文本 新闻

细节

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版本 1.18.0
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R (>= 3.5.0),SummarizedExperiment
进口
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建议 BiocStyleknitrrmarkdownDESeq2
SystemRequirements
增强了
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全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 miRmine_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 miRmine_1.18.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) miRmine_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRmine
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRmine
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/miRmine/
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