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- Bioconductor 3.16
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- miRNAtap
miRNAtap
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DOI:10.18129 / B9.bioc.miRNAtap
miRNAtap:微目标-聚合的预测
Bioconductor版本:版本(3.16)
包方便的实现工作流需要microrna的预测,它允许集成网上排名来自多个源的microrna的目标预测,总以各种方法可以改善预测的质量高于任何单一来源。目前可用于预测智人,亩肌肉和鼠形(最后一个通过同源性翻译)。
作者:Maciej Pajak, t .伊恩·辛普森
维修工:t伊恩·辛普森<伊恩。辛普森在ed.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“miRNAtap”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“miRNAtap”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“miRNAtap”)
| R脚本 | miRNAtap | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.32.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(8.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.3.0),AnnotationDbi |
| 进口 | DBI,RSQLite,stringr,sqldf,plyr、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | topGO,org.Hs.eg.db,miRNAtap.db,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | miRNAtap.db |
| 进口我 | miRNAtap.db,SpidermiR |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | miRNAtap_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | miRNAtap_1.32.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | miRNAtap_1.32.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | miRNAtap_1.32.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRNAtap |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRNAtap |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/miRNAtap/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/miRNAtap/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
