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miRBaseConverter
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DOI:10.18129 / B9.bioc.miRBaseConverter
全面、高效的工具转换和检索信息的不同miRBase microrna的版本
Bioconductor版本:版本(3.15)
全面的工具转换和检索microrna的名称、加入、序列、版本、历史和家庭信息在不同miRBase版本。它可以处理大量的microrna在短时间内没有其他视情况而定。
作者:Taosheng徐< Taosheng。在gmail.com x >,Thuc Le
维护人员:徐Taosheng < Taosheng。在gmail.com x >
从内部引用(R,回车引用(“miRBaseConverter”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“miRBaseConverter”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“miRBaseConverter”)
| HTML | R脚本 | miRBaseConverter:全面、高效转换和检索信息的工具不同miRBase microrna的版本 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.4) |
| 进口 | 统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocGenerics,RUnit,knitr,rtracklayer跑龙套,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/taoshengxu/miRBaseConverter |
| BugReports | https://github.com/taoshengxu/miRBaseConverter/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | ExpHunterSuite,海绵 |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | miRBaseConverter_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | miRBaseConverter_1.20.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | miRBaseConverter_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRBaseConverter |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRBaseConverter |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/miRBaseConverter/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
