甲基冰盖

doi：10.18129/b9.bioc.methylscaper

甲基化数据的可视化

生物导体版本：版本（3.15）

甲基冰盖是用于处理和可视化数据共同分析甲基化和染色质可及性（Mapit，Nome-Seq，Scnmt-Seq，纳米组等）的R包装。该软件包支持单细胞和单分子数据，以及通过生成有序的代表性甲基化态矩阵共同可视化这两种数据类型的常见界面。闪亮的应用程序允许进行改进和重新加权的交互式序列化过程，以最佳地命令细胞或DNA分子发现甲基化模式和核小体定位。

作者：Bacher Rhonda [AUT，CRE]，Parker Knight [AUT]

维护者：ufl.edu的Bacher Rhonda

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“甲基刺”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“甲基闻”）

html	R脚本	使用甲基冰盖可视化关节甲基化和核小体占用数据
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文本		消息

细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	GPL-2
要看	R（> = 4.1.0）
进口	闪亮的，，，，Shinyjs，，，，串行，，，，生物比较，，，，seqinr，，，，生物弦，，，，rfast，Grdevices，图形，统计，UTILS，工具，方法，光泽，，，，Data.Table，，，，总结性特征
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，DevTools
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	甲基Scaper_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	甲基Scaper_1.4.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	甲基Scaper_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylscaper
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/甲基冰淇淋
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/methylscaper/
软件包下载报告	下载统计