甲基管
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doi：10.18129/b9.bioc.methylpipe
基础分辨率DNA甲基化数据分析
生物导体版本：版本（3.12）
CPG和非CPG序列上下文中基础分辨率DNA甲基化数据的记忆有效分析。从提供基础或低分辨率数据的任何方法中得出的DNA甲基化数据的整合。
作者：Kamal Kishore
维护者：kamal kishore
引用（从r内，输入引用（“甲基管”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“甲基水管”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“甲基管”）
| R脚本 | 甲基植物.pdf | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（6。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.2.0），方法，grdevices，图形，统计，utils，基因组机，，，，总结性特征（> = 0.2.0），rsamtools |
| 进口 | Marray，，，，GPLOTS，，，，iranges，，，，生物基因，，，，GVIZ，，，，基因组签名，，，，生物弦， 平行，Data.Table，，，，GenomeInfodB，，，，S4VECTORS |
| 链接 | |
| 建议 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown，，，，尼特，，，，甲基赛克 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | Listeretalbsseq |
| 进口我 | Compepitools |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | 甲基Pipe_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | 甲基Pipe_1.24.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | 甲基Pipe_1.24.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylpipe |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/甲基管 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/methylpipe/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
