甲基管

doi:10.18129/b9.bioc.methylpipe

基础分辨率DNA甲基化数据分析

生物导体版本:版本(3.12)

CPG和非CPG序列上下文中基础分辨率DNA甲基化数据的记忆有效分析。从提供基础或低分辨率数据的任何方法中得出的DNA甲基化数据的整合。

作者:Kamal Kishore

维护者:kamal kishore

引用(从r内,输入引用(“甲基管”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“甲基水管”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“甲基管”)

PDF R脚本 甲基植物.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(6。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.2.0),方法,grdevices,图形,统计,utils,基因组机,,,,总结性特征(> = 0.2.0),rsamtools
进口 Marray,,,,GPLOTS,,,,iranges,,,,生物基因,,,,GVIZ,,,,基因组签名,,,,生物弦, 平行,Data.Table,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown,,,,尼特,,,,甲基赛克
系统要求
增强
URL
取决于我 Listeretalbsseq
进口我 Compepitools
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 甲基Pipe_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 甲基Pipe_1.24.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) 甲基Pipe_1.24.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylpipe
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/甲基管
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/methylpipe/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网