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methimpute
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DOI:10.18129 / B9.bioc.methimpute
Imputation-guided改造完成methylomes WGBS数据
Bioconductor版本:版本(3.15)
这个包实现函数调用所有基因组中胞核嘧啶甲基化。
作者:亚伦Taudt
维护人员:亚伦Taudt <亚伦。在gmail.com taudt >
从内部引用(R,回车引用(“methimpute”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“methimpute”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“methimpute”)
| R脚本 | 甲基化状态与METHimpute调用 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.5.0),GenomicRanges,ggplot2 |
| 进口 | Rcpp(> = 0.12.4.5)、方法、效用,grDevices,统计数据,GenomeInfoDb,IRanges,Biostrings,reshape2,minpack.lm,data.table |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | knitr,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | methimpute_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | methimpute_1.18.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | methimpute_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methimpute |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ methimpute |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/methimpute/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
