生物导体版本:版本(3.15)
该软件包为Metaviz Web应用程序(http://metaviz.cbcb.umd.edu)提供了WebSocket通信,以进行元基因组学数据的交互式可视化。R/Bioc交互式会话中的对象可以在图中显示,可以使用acketzoom可视化探索数据。支持基本的生物导体数据结构(例如,mrexperiment对象),同时提供了一种简单的机制来支持其他数据结构。可视化(使用d3.js)也可以轻松地添加到Web应用程序中。
作者:Hector Corrada Bravo [CRE,AUT],Florin Chelaru [AUT],Justin Wagner [AUT],Jayaram Kancherla [aut],Joseph Paulson [aut]
维护者:hector Corrada bravo
引用(从r内,输入引用(“ metavizr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ metavizr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ metavizr”)
html | R脚本 | Metavizr简介 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.20.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | r(> = 3.4),元基因组(> = 1.17.1),方法,Data.Table,,,,生物酶,,,,消化 |
进口 | epivizr,,,,epivizrdata,,,,Epivizrserver,,,,EPIVIZRSTANTALLONE,,,,素食主义者,,,,GenomeInfodB,,,,门索,,,,httr |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,生物使用,,,,矩阵,,,,MSD16S(> = 0.109.1),ETEC16S,,,,测试,,,,GSS,,,,实验室,,,,花花公子,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | metavizr_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | metavizr_1.20.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | metavizr_1.20.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metavizr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/metavizr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/metavizr/ |
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