metaseqr2

doi：10.18129/b9.bioc.metaseqr2

通过组合多个统计算法的R NA-SEQ数据分析和结果报告的R软件包

生物导体版本：版本（3.13）

为RNA-Seq基因表达数据提供了几个归一化和统计测试包的接口。此外，它创建了几个诊断图，通过结合几个统计测试的结果并以交互式方式报告结果，从而执行荟萃分析。

作者：Panagiotis Moulos [AUT，CRE]

维护者：panagiotis moulos

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ metaseqr2”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ metaseqr2”）

html	R脚本	为metaseqr2构建注释数据库
html	R脚本	使用MetaseQR2的RNA-seq数据分析
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细节

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版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（1年）
执照	GPL（> = 3）
要看	r（> = 4.0.0），deseq2，，，，林玛，，，，Locfit，花键
进口	absseq，，，，贝塞克，，，，生物酶，，，，生物基因，，，，生物比较，，，，Biomart，，，，生物弦，，，，Corrplot，，，，DSS，，，，DT，，，，EDASEQ，，，，EDGER，，，，GeneFilter，，，，GenomeInfodB，，，，基因组签名，，，，GenomicFeatures，，，，基因组机，，，，GPLOTS，图形，grdevices，谐波，，，，热图，，，，htmltools，，，，httr，，，，iranges，，，，jsonlite，，，，格子，，，，log4r，，，，马格里特，，，，大量的，，，，矩阵， 方法，NBPSEQ，，，，潘德， 平行，QVALUE，，，，rmarkDown，，，，rmdformats，，，，rsamtools，，，，rsqlite，，，，rtracklayer，，，，S4VECTORS，统计Stringr，，，，总结性特征，，，，survomp，utils，Venndiagram，，，，VSN，，，，Yaml，，，，动物园
链接
建议	生物管理器，，，，BSGENOME，，，，尼特，，，，rmysql，，，，运行
系统要求
增强	TCC
URL	http://www.fleming.gr
BugReports	https://github.com/pmoulos/metaseqr2/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	metaseqr2_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	metaseqr2_1.4.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	metaseqr2_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metaseqr2
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/metaseqr2
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/metaseqr2/
软件包下载报告	下载统计