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metabolomicsWorkbenchR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.metabolomicsWorkbenchR
代谢组学工作台在R
Bioconductor版本:发行版(3.16)
这个包提供了与Metabolomics Workbench RESTful API接口的函数。研究，化合物，蛋白质和基因信息可以使用API搜索。还包括在常见的生物导体格式中获取研究数据的方法，如summarizeexperiment和MultiAssayExperiment。
作者:加文·里斯·劳埃德[aut, cre]，拉尔夫·约翰内斯·玛丽亚·韦伯[aut]
维护者:Gavin Rhys Lloyd
引文(从R内，输入引用(“metabolomicsWorkbenchR”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“metabolomicsWorkbenchR”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 使用structToolbox的示例 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | Introduction_to_metabolomicsWorkbenchR |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.0) |
| 进口 | data.table，httr，jsonlite、方法、MultiAssayExperiment，结构体，SummarizedExperiment,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，covr，knitr，HDF5Array，rmarkdown，structToolbox，testthat，pmp、网格png |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | fobitools |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | metabolomicsWorkbenchR_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | metabolomicsWorkbenchR_1.8.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | metabolomicsWorkbenchR_1.8.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | metabolomicsWorkbenchR_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metabolomicsWorkbenchR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/metabolomicsWorkbenchR |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/metabolomicsWorkbenchR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/metabolomicsWorkbenchR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
