MBKmeans.

DOI：10.18129 / b9.bioc.mbkmeans.

单细胞RNA-SEQ的迷你批量k-means聚类

Bioconductor版本：释放（3.13）

实现用于大型数据集的迷你批量k均值算法，包括支持磁盘上的数据表示。

作者：yuwei ni [aut，cph]，davide risso [aut，cre，cph]，Stephanie hicks [aut，cph]，伊丽莎白语文[aut，cph]

维护者：Davide Risso

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“mbkmeans”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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HTML.	r script.	MBKMeans小插图
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文本		执照

细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.8.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.9（R-3.6）（2年）
执照	mit +文件执照
依靠	r（> = 3.6）
进口	方法，delayedarray那rcpp.那S4Vectors.那SinglecellexPeriment.那概括分析那Clusterr.那基准ME.那矩阵那生物相投
链接到	rcpp.那rcpparmadillo（> = 0.7.2），RHDF5LIB.那海滩日那Clusterr.
建议	海滩日那HDF5Array.那RHDF5LIB.那生物焦那tenxpbmcdata.那撒尿那delayedmatrixstats那吹风丝那kn那testthat.那RAMAMAMDOW.
系统要求	C ++ 11.
加强
URL.
Bugreports.	https://github.com/drisso/mbkmeans/issues.
取决于我
进口我	丁浓缩那scdblfinder.
建议我	吹风丝
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	mbkmeans_1.8.0.tar.gz.
Windows二进制文件	mbkmeans_1.8.0.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	mbkmeans_1.8.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/mbkmeans.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ MBKmeans
包短网址	https://biocumon.org/packages/mbkmeans/
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