mbOmic

DOI:10.18129 / B9.bioc.mbOmic

综合分析微生物的代谢物

Bioconductor版本:版本(3.16)

mbOmic包包含一组microbiomics和代谢组学数据的分析功能,旨在分析inter-omic微生物学和代谢物之间的相关性。综合分析微生物的代谢物mbOmic的目的。此外,菌群使用肠道微生物群却能合成更多形成丰富的识别是preliminaryimplemented。

作者:聪聪锣(aut (cre)

维护人员:聪聪龚< congconggong33 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“mbOmic”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	enterotyping
HTML	R脚本	综合分析代谢物和微生物
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1.0)
进口	平行,doParallel,心理,WGCNA,data.table,igraph,visNetwork,集群,clusterSim、方法、图形、统计数据
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),knitr,rmarkdown,devtools,嫁祸于
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/gongcongcong/mbOmic
BugReports	https://github.com/gongcongcong/mbOmic/issues
取决于我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	mbOmic_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	mbOmic_1.2.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	mbOmic_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	mbOmic_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mbOmic
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mbOmic
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/mbOmic/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mbOmic/
包下载报告	下载数据