Bioconductor版本:发行版(3.16)
这个包可以帮助用户在自己的miCLIP2数据上运行m6Aboost模型。该包包含分配读取计数和获取运行m6Aboost模型的特性的函数。miCLIP2数据应该存储在GRanges对象中。更多细节可以在小插图中找到。
维护者:You Zhou
引文(从R内,输入引用(“m6Aboost”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("m6Aboost")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“m6Aboost”)
超文本标记语言 | R脚本 | m6Aboost小插曲 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | S4Vectors,adabag,GenomicRanges, r (>= 4.1) |
进口 | dplyr,rtracklayer,BSgenome,Biostrings, utils,方法,IRanges,ExperimentHub |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,bookdown,testthat,BiocStyle,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/ZarnackGroup/m6Aboost |
BugReports | https://github.com/ZarnackGroup/m6Aboost/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | m6Aboost_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | m6Aboost_1.4.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | m6Aboost_1.4.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | m6Aboost_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/m6Aboost |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/m6Aboost |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/m6Aboost/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/m6Aboost/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |