kissDE

DOI:10.18129 / B9.bioc.kissDE

检索RNA-Seq数据中的条件特定变体

Bioconductor版本:发行版(3.16)

检索RNA-seq数据中特定条件的变体(snv，替代剪接，indels)。它被开发为“KisSplice”的后处理，但也可以用于用户自己的数据。

作者:Clara Benoit-Pilven [aut]， Camille Marchet [aut]， Janice Kielbassa [aut]， Lilia Brinza [aut]， Audric Cologne [aut]， Aurélie Siberchicot [aut, cre]， Vincent Lacroix [aut]， Frank Picard [ctb]， Laurent Jacob [ctb]， Vincent Miele [ctb]

维护者:Aurélie Siberchicot

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“kissDE”)

PDF	R脚本	kissDE.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(4.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于
进口	aods3，Biobase，DESeq2，DSS，ggplot2，gplots，图形，grDevices，matrixStats，统计，utils，foreach，doParallel平行,闪亮的，shinycssloaders，ade4，factoextra，DT
链接
建议	BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	kissDE_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	kissDE_1.18.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	kissDE_1.18.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	kissDE_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/kissDE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/kissDE
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/kissDE/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/kissDE/
软件包下载报告	下载数据