Iasva
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.iasva
迭代调整后的替代变量分析
生物导体版本：版本（3.15）
迭代调整后的替代变量分析（IA-SVA）是一个统计框架，即使这些来源相关，也可以发现隐藏的变化来源。IA-SVA为i）提供了一种灵活的方法，i）在调整所有已知因素的同时，确定一个隐藏的异质性因素；ii）测试假定的隐藏因素对于解释数据中未建模的变化的重要性；iii），如果显着，则将估计因子用作接下来迭代中的附加因素，以发现进一步的隐藏因素。
作者：Donghyung Lee [AUT，CRE]，Anthony Cheng [aut]，Nathan Lawlor [AUT]，Duygu Ucar [aut]
维护者：donghyung lee
引用（从r内，输入引用（“ Iasva”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ iasva”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Iasva”）
| html | R脚本 | 在单细胞RNA-seq数据中检测隐藏的异质性 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | R（> = 3.5） |
| 进口 | irlba，统计簇，图形，总结性特征，，，，生物比较 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，测试，，，，rmarkDown，，，，SVA，，，，RTSNE，，，，pheatmap，，，，Corrplot，，，，desctools，，，，rcolorbrewer |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | iasva_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | iasva_1.14.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | iasva_1.14.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iasva |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/iasva |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/iasva/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
