Iasva

doi:10.18129/b9.bioc.iasva

迭代调整后的替代变量分析

生物导体版本:版本(3.15)

迭代调整后的替代变量分析(IA-SVA)是一个统计框架,即使这些来源相关,也可以发现隐藏的变化来源。IA-SVA为i)提供了一种灵活的方法,i)在调整所有已知因素的同时,确定一个隐藏的异质性因素;ii)测试假定的隐藏因素对于解释数据中未建模的变化的重要性;iii),如果显着,则将估计因子用作接下来迭代中的附加因素,以发现进一步的隐藏因素。

作者:Donghyung Lee [AUT,CRE],Anthony Cheng [aut],Nathan Lawlor [AUT],Duygu Ucar [aut]

维护者:donghyung lee ,anthony cheng

引用(从r内,输入引用(“ Iasva”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ iasva”)

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文档

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Browsevignettes(“ Iasva”)

html R脚本 在单细胞RNA-seq数据中检测隐藏的异质性
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版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(3.5岁)
执照 GPL-2
要看 R(> = 3.5)
进口 irlba,统计,图形,总结性特征,,,,生物比较
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源包 iasva_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 iasva_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) iasva_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iasva
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/iasva
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/iasva/
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