- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- hopach
hopach
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.hopach
分层要求分区和混合(HOPACH)崩溃
Bioconductor版本:版本(3.16)
HOPACH聚类算法构建集群的层次树递归分区数据集,而排序和可能崩溃在每个水平集群。算法使用均值/中值分割轮廓(MSS)标准确定树的水平,最大限度地均匀集群。它也运行树下生产最后一个元素的有序列表。非参数引导允许一个估计的概率每个元素属于每个集群(模糊聚类)。
作者:凯瑟琳·s·波拉德,范德朗Mark j . <拉恩说道:stat.berkeley.edu >和格雷格墙
维护人员:凯瑟琳·s·波拉德<凯瑟琳。波拉德:gladstone.ucsf.edu >
从内部引用(R,回车引用(“hopach”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“hopach”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“hopach”)
| R脚本 | hopach | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.58.0 |
| Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 2.11.0),集群,Biobase、方法 |
| 进口 | 图形、grDevices统计,跑龙套,BiocGenerics |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.stat.berkeley.edu/ ~拉恩说道/http://docpollard.org/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | phenoTest,scClassify,treekoR |
| 建议我 | MicrobiotaProcess,seqArchR |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | hopach_2.58.0.tar.gz |
| Windows二进制 | hopach_2.58.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | hopach_2.58.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | hopach_2.58.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hopach |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ hopach |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/hopach/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/hopach/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
