hipathia

DOI:10.18129 / B9.bioc.hipathia

HiPathia:高通量途径分析

Bioconductor版本:版本(3.13)

Hipathia是计算的方法从转录组数据的信号转导信号通路。方法是基于迭代算法可以计算出通过一个网络节点的信号强度考虑每一个基因的表达水平和信号的强度。它还提供了一种新方法功能分析允许计算信号到达每个通路的功能注释。

作者:玛尔塔·r·伊达尔戈(aut (cre),何塞Carbonell-Caballero[所有],旧金山Salavert[所有],艾丽西亚Amadoz[所有],Cankut Cubuk[所有],华金Dopazo(施)

维修工:玛尔塔·r·伊达尔戈<玛尔塔。伊达尔戈在outlook.es >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“hipathia”)

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文档

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PDF	R脚本	Hipathia包
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	2.8.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.6),igraph(> = 1.0.1),AnnotationHub(> = 2.6.5),MultiAssayExperiment(> = 1.4.9),SummarizedExperiment(> = 1.8.1)
进口	硬币统计数据,limmagrDevices跑龙套,图形,preprocessCore,servr,DelayedArray,matrixStats、方法、S4Vectors
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	hipathia_2.8.0.tar.gz
Windows二进制	hipathia_2.8.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	hipathia_2.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hipathia
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ hipathia
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hipathia/
包下载报告	下载数据