Hireadsprocessor
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doi：10.18129/b9.bioc.hireadsprocessor
处理LM-PCR读取的功能454/Illumina数据
生物导体版本：版本（3.15）
HireadsProcessor包含一组功能，使用户可以处理使用任何平台测序的LM-PCR产品。给定一个包含用于反复分解和样品元数据的参数的Excel/TXT文件，该功能自动化适配器的修剪和基因组产物的识别。进一步处理QC和丰度定量的基因组产物。
作者：nirav v malani
维护者：nirav v malani
引用（从r内，输入引用（“ Hireadsprocessor”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Hireadsprocessor”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Hireadsprocessor”）
| html | R脚本 | 使用HireadsProcessor |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.32.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（7。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），生物弦，，，，基因组签名，，，，生物比较，，，，Hiannotator |
| 进口 | Soniclength，，，，dplyr，，，，生物基因，，，，基因组机，，，，readxl， 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，测试，，，，降价 |
| 系统要求 | blat，UCSC HG18以2位格式用于布拉特 |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | hireadsprocessor_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | hireadsprocessor_1.32.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hireadsprocessor |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/hireadsprocessor |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/hireadsprocessor/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
