Hiannotator
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doi：10.18129/b9.bioc.hiannotator
注释Granges对象的功能
生物导体版本：版本（3.13）
Hiannotator包含一组功能，允许用户用自定义注释集对Granges对象进行注释。该软件包的基本理念是将两个granges对象（查询和主题）带有常见的seqnames（即染色体），并从seqnames中返回相关的注释，并从查询匹配的seqnames和行中的行（即基因或cpg群岛）中的行。）。该软件包带有三种类型的注释函数，它们计算出查询的位置是否为：在功能，靠近功能或定义窗口大小中的计数功能。此外，每个功能都配备了并行后端，以利用foreach软件包。此外，该软件包还配备了包装器功能，该功能找到了从通用数据框架制作Granges对象所需的适当列。
作者：nirav v malani
维护者：nirav v malani
引用（从r内，输入引用（“ hiannotator”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ hiannotator”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Hiannotator”）
| html | R脚本 | 使用hiannotator |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.26.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（6。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | 基因组机，R（> = 2.10） |
| 进口 | foreach，，，，迭代器，，，，rtracklayer，，，，dplyr，，，，BSGENOME，，，，GGPLOT2，，，，秤， 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，多帕尔，，，，测试，，，，生物基因 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | Hireadsprocessor |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | hiannotator_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | hiannotator_1.26.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | hiannotator_1.26.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hiannotator |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/hiannotator |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/hiannotator/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
