gwascat

DOI:10.18129 / B9.bioc.gwascat

EMBL-EBI GWAS目录中的数据表示和建模

Bioconductor版本:发行版(3.15)

在EMBL-EBI GWAS目录中表示和建模数据。

作者:VJ Carey

维护者:VJ Carey

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" gwwascat ")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“gwascat”)

超文本标记语言	R脚本	gwascat—EBI目录中GWAS命中的grange
超文本标记语言	R脚本	构造和查询NHGRI GWAS目录
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	2.28.1
Bioconductor自	BioC 2.10 (R-2.15)(10.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.5.0)，方法
进口	S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges(> = 1.29.6),GenomicFeatures，readr，Biostrings，AnnotationDbi，BiocFileCache，snpStats，VariantAnnotation，AnnotationHub
链接
建议	DO.db，DT，knitr，RBGL，testthat，rmarkdown，Gviz，Rsamtools，IRanges，rtracklayer，图，ggbio，DelayedArray，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，org.Hs.eg.db，BiocStyle
SystemRequirements
增强了	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
URL
取决于我	liftOver，vtpnet
进口我	circRNAprofiler
建议我	GenomicScores，grasp2db，hmdbQuery，ldblock，parglms，TFutils
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	gwascat_2.28.1.tar.gz
Windows二进制	gwascat_2.28.1.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	gwascat_2.28.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gwascat
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gwascat/
包下载报告	下载数据
bioc3.15的旧源包	源存档