gtrellis

DOI:10.18129 / B9.bioc.gtrellis

基因组级网格布局

Bioconductor版本:发行版(3.13)

基因组水平格状图以基因组类别(例如染色体)为条件可视化基因组数据。对于每个基因组类别，以轨迹表示的多维数据从不同方面描述了不同的特征。该软件包提供了高度的灵活性来安排基因组类别，并在图中添加自定义的图形。

作者:顾祖光

维护者:祖光谷

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("gtrellis")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“gtrellis”)

超文本标记语言	R脚本	制作基因组级别的格子图
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R(>= 3.1.2)，网格，IRanges，GenomicRanges
进口	circlize(> = 0.4.8),GetoptLong， grDevices, utils
链接
建议	testthat(> = 1.0.0),knitr，RColorBrewer，减价，ComplexHeatmap(> = 1.99.0),开罗，png，jpeg，tiff
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/gtrellis
全靠我
进口我	YAPSA
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	gtrellis_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	gtrellis_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	gtrellis_1.24.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gtrellis
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gtrellis
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gtrellis/
软件包下载报告	下载数据