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groHMM
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DOI:10.18129 / B9.bioc.groHMM
GRO-seq分析管道
Bioconductor版本:Release (3.15)
用于分析GRO-seq数据的管道。
作者:Charles G. Danko, Minho Chae, Andre Martins, W. Lee Kraus
维护者:Anusha Nagari < Anusha。nagari at utsouthwest n.edu>， Tulip Nandu <郁金香。W. Lee Kraus < Lee . Kraus at utsouthwest n.edu>
引文(从R内，输入引用(“groHMM”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“groHMM”)
| R脚本 | groHMM教程 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.30.1 |
| 在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(八年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.5.0)，质量平行,S4Vectors(> = 0.17.25),IRanges(> = 2.13.12),GenomeInfoDb，GenomicRanges(> = 1.31.8),GenomicAlignments(> = 1.15.6),rtracklayer(> = 1.39.7) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，GenomicFeatures，刨边机，org.Hs.eg.db，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/Kraus-Lab/groHMM |
| BugReports | https://github.com/Kraus-Lab/groHMM/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | groHMM_1.30.1.tar.gz |
| Windows二进制 | groHMM_1.30.1.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | groHMM_1.30.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/groHMM |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/groHMM |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/groHMM/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.15的旧源包 | 源存档 |
