Goseq

doi:10.18129/b9.bioc.goseq

RNA-seq和其他长度偏置数据的基因本体论分析仪

生物导体版本:版本(3.15)

检测RNA-seq数据中代表的基因本体论和/或其他用户定义的类别

作者:Matthew Young

维护者:Matthew Young ,nadia Davidson

引用(从r内,输入引用(“ Goseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Goseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Goseq”)

PDF R脚本 Goseq用户指南
PDF 参考手册

细节

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版本 1.48.0
在生物导体中 Bioc 2.6(R-2.11)(12年)
执照 LGPL(> = 2)
要看 r(> = 2.11.0),偏见,,,,Genelendatabase(> = 1.9.2)
进口 MGCV,图形,统计,utils,AnnotationDbi,,,,go.db,,,,生物基因
链接
建议 EDGER,,,,org.hs.eg.db,,,,rtracklayer
系统要求
增强
URL
取决于我 RGSEPD
进口我 冠军,,,,理想的,,,,Smite
建议我 麻雀
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 goseq_1.48.0.tar.gz
Windows二进制 goseq_1.48.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) goseq_1.48.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/goseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/goseq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/goseq/
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