goSorensen

DOI:10.18129 / B9.bioc.goSorensen

基于Sorensen-Dice不相似度和基因本体(GO)的统计推理

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这个包实现了推理方法来比较基因列表(在第一个版本中，以证明等价性)在GO中表达的生物学意义。比较基因列表的特征是由富集GO项目的交叉表频率表。使用Sorensen-Dice指数评估基因列表之间的不相似性。其基本指导原则是，如果两个基因列表共享大量共同富集的GO项，则视为相似。

作者:Pablo Flores [aut, cre]， Jordi Ocana [aut, ctb] (0000-0002-4736-699)， Alexandre Sanchez-Pla [ctb]， Miquel Salicru [ctb]

维护者:Pablo Flores

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“goSorensen”)

超文本标记语言	R脚本	介绍了用goSorensen进行特征列表间等价性检验的方法。
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版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.16 (R-4.2)(< 6个月)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.2.0)
进口	GO.db，org.Hs.eg.db，goProfiles统计数据,clusterProfiler、并行
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	goSorensen_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	goSorensen_1.0.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	goSorensen_1.0.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	goSorensen_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/goSorensen
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/goSorensen
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/goSorensen/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/goSorensen/
软件包下载报告	下载数据