Glmgampoi

doi:10.18129/b9.bioc.glmgampoi

拟合γ-频森广义线性模型

生物导体版本:版本(3.13)

拟合线性模型以过度分散计数数据。该软件包可以估计过度分散并适合矩阵输入的重复模型。它旨在处理大型输入数据集,因为它们通常发生在单细胞RNA-seq实验中。

作者:康斯坦丁·艾尔曼·埃尔特兹[AUT,CRE],迈克尔·洛夫[CTB]

维护者:constantin ahlmann-teltze

引用(从r内,输入引用(“ Glmgampoi”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ glmgampoi”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Glmgampoi”)

html R脚本 Glmgampoi Quickstart
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(1年)
执照 GPL-3
要看
进口 RCPP,,,,延迟的matrixstats,,,,矩阵,,,,延迟,,,,HDF5Array,,,,总结性特征,,,,生物基因,方法,统计,utils,splines
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo,,,,beachmat
建议 测试(> = 2.1.0),动物园,,,,deseq2,,,,EDGER,,,,林玛,,,,beachmat,,,,大量的,,,,Statmod,,,,GGPLOT2,,,,长椅,,,,生物比较,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,tenxpbmcdata,,,,muscdata,,,,斯克兰
系统要求 C ++ 11
增强
URL https://github.com/const-ae/glmgampoi
BugReports https://github.com/const-ae/glmgampoi/issues
取决于我
进口我
建议我 deseq2
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构建报告

包装档案

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源包 glmgampoi_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 glmgampoi_1.4.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) glmgampoi_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/glmgampoi
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/glmgampoi
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/glmgampoi/
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