生物导体版本:版本(3.13)
拟合线性模型以过度分散计数数据。该软件包可以估计过度分散并适合矩阵输入的重复模型。它旨在处理大型输入数据集,因为它们通常发生在单细胞RNA-seq实验中。
作者:康斯坦丁·艾尔曼·埃尔特兹[AUT,CRE],迈克尔·洛夫[CTB]
维护者:constantin ahlmann-teltze
引用(从r内,输入引用(“ Glmgampoi”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ glmgampoi”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Glmgampoi”)
html | R脚本 | Glmgampoi Quickstart |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(1年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | |
进口 | RCPP,,,,延迟的matrixstats,,,,矩阵,,,,延迟,,,,HDF5Array,,,,总结性特征,,,,生物基因,方法,统计,utils,splines |
链接 | RCPP,,,,rcpparmadillo,,,,beachmat |
建议 | 测试(> = 2.1.0),动物园,,,,deseq2,,,,EDGER,,,,林玛,,,,beachmat,,,,大量的,,,,Statmod,,,,GGPLOT2,,,,长椅,,,,生物比较,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,tenxpbmcdata,,,,muscdata,,,,斯克兰 |
系统要求 | C ++ 11 |
增强 | |
URL | https://github.com/const-ae/glmgampoi |
BugReports | https://github.com/const-ae/glmgampoi/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | deseq2 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | glmgampoi_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | glmgampoi_1.4.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | glmgampoi_1.4.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/glmgampoi |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/glmgampoi |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/glmgampoi/ |
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