ggtreeExtra

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggtreeExtra

R包添加几何层圆形或其他布局树“ggtree”

Bioconductor版本:版本(3.16)

ggtreeExtra扩展映射方法和可视化相关数据在种系发生树使用“ggtree”。这些相关数据可以在外部板环形布局,风扇布局,或其他矩形布局树由“ggtree”与“ggplot2”的语法。

作者:Shuangbin徐(aut (cre),Guangchuang Yu (aut,施莱)

维护人员:徐Shuangbin < xshuangbin 163. com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ggtreeExtra”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ggtreeExtra”)

HTML	R脚本	ggtreeExtra
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文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于
进口	ggplot2跑龙套,rlang,ggnewscale统计数据,ggtree,tidytree(> = 0.3.9),cli
链接
建议	treeio,ggstar,拼接而成,knitr,rmarkdown,prettydoc,减价,testthat(> = 3.0.0),支柱
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/YuLab-SMU/ggtreeExtra/
BugReports	https://github.com/YuLab-SMU/ggtreeExtra/issues
取决于我
进口我	MicrobiotaProcess
建议我	enrichplot,ggmsa
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ggtreeExtra_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	ggtreeExtra_1.8.1.zip
macOS二进制(x86_64)	ggtreeExtra_1.8.1.tgz
macOS二进制(arm64)	ggtreeExtra_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggtreeExtra
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ggtreeExtra
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ggtreeExtra/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ggtreeExtra/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.16源码包	源存档