ggspavis

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggspavis

空间解析转录组数据的可视化功能

Bioconductor版本:发行版(3.16)

以SpatialExperiment格式存储的空间解析转录组学数据集的可视化功能。包括从基于点(例如10x Genomics Visium)和基于分子(例如seqFISH)的技术平台为数据创建几种类型的图的功能。

作者:卢卡斯·m·韦伯[aut, cre]——海伦娜·l·克罗威尔[au]

维护人员:Lukas M. Weber < lukas.web.edu at gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ggspavis”)

超文本标记语言	R脚本	ggspavis概述
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.4.0
在Bioconductor	bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	ggplot2
进口	SpatialExperiment，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，ggside，网格，方法，统计
链接
建议	BiocStyle，rmarkdown，knitr，STexampleData，BumpyMatrix，嘘，食物，uwot，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lmweber/ggspavis
BugReports	https://github.com/lmweber/ggspavis/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ggspavis_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	ggspavis_1.4.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	ggspavis_1.4.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ggspavis_1.4.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggspavis
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ggspavis
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ggspavis/
软件包下载报告	下载数据