ggspavis

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggspavis

空间解析转录组数据的可视化功能

Bioconductor版本:发行版(3.16)

以SpatialExperiment格式存储的空间解析转录组学数据集的可视化功能。包括从基于点(例如10x Genomics Visium)和基于分子(例如seqFISH)的技术平台为数据创建几种类型的图的功能。

作者:卢卡斯·m·韦伯[aut, cre]——海伦娜·l·克罗威尔[au]

维护人员:Lukas M. Weber < lukas.web.edu at gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“ggspavis”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ggspavis”)

超文本标记语言 R脚本 ggspavis概述
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.4.0
在Bioconductor bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 ggplot2
进口 SpatialExperimentSingleCellExperimentSummarizedExperimentggside,网格,方法,统计
链接
建议 BiocStylermarkdownknitrSTexampleDataBumpyMatrix食物uwottestthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/lmweber/ggspavis
BugReports https://github.com/lmweber/ggspavis/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ggspavis_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 ggspavis_1.4.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) ggspavis_1.4.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) ggspavis_1.4.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggspavis
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ggspavis
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ggspavis/
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