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gep2pep
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DOI:10.18129 / B9.bioc.gep2pep
途径表达谱(PEPs)的创建与分析
Bioconductor版本:发行版(3.16)
途径表达谱(pep)是基于途径的表达(定义为一组基因)，而不是单个基因。该软件包将基因表达谱转换为pep，并分别对通路和实验条件进行富集分析，如“药物集富集分析”和“gene2drug”药物发现分析。
作者:Francesco Napolitano
维护者:Francesco Napolitano
引文(从R内，输入引用(“gep2pep”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“gep2pep”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | gep2pep介绍 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.7 (R-3.5)(4.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | |
| 进口 | 回购(> = 2.1.1),foreach，统计，utils，GSEABase、方法、Biobase，XML，rhdf5，消化，迭代器 |
| 链接 | |
| 建议 | WriteXLS，testthat，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | gep2pep_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gep2pep_1.18.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | gep2pep_1.18.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | gep2pep_1.18.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gep2pep |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gep2pep |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/gep2pep/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gep2pep/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
