geneplast

DOI:10.18129 / B9.bioc.geneplast

进化和塑性分析同源组

Bioconductor版本:版本(3.15)

Geneplast是专为进化和塑性分析基于同源组分布在一个给定的物种树。它使用香农信息论和直接同源丰度估计进化的塑性指数。此外,它实现了桥算法来确定一个给定的基因的进化根源基于其直接同源分布。

作者:罗德里戈Dalmolin,毛罗·卡斯特罗

维护人员:毛罗·卡斯特罗< mauro.a。卡斯特罗在gmail.com >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“geneplast”)

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HTML	R脚本	Geneplast:进化和塑性分析。加油
HTML	R脚本	Trefflich2019辅助材料。
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 4.0),方法
进口	igraph,雪,猿grDevices图形,统计,跑龙套,data.table
链接
建议	研制,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,knitr,rmarkdown,Fletcher2013b,geneplast.data.string.v91,ggplot2,ggpubr,plyr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	geneplast.data,TreeAndLeaf
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包档案

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源包	geneplast_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	geneplast_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64)	geneplast_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geneplast
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ geneplast
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/geneplast/
包下载报告	下载数据