genefilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.genefilter

基因过滤器:从高通量实验中过滤基因的方法

Bioconductor版本:Release (3.15)

筛选基因的一些基本功能。

作者:Robert Gentleman, Vincent J. Carey, Wolfgang Huber, Florian Hahne

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“genefilter”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“genefilter”)

PDF R脚本 使用基因过滤器功能从微阵列数据集中过滤基因
PDF R脚本 02 -如何找到表达谱与指定基因相似的基因
PDF R脚本 03 -额外的图:独立过滤增加了检测差异表达基因的能力,Bourgon等人,PNAS (2010)
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

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版本 1.78.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 17年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 BiocGenericsAnnotationDbi注释Biobase,图形,方法,统计,生存, grDevices
链接
建议 hgu95av2.dbtkWidgets所有中华民国RColorBrewerBiocStyleknitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 cellHTS2CNToolsGeneMetaHiiragi2013maEndToEndrnaseqGeneSISPA股东价值分析
进口我 a4BaseannmaparrayQualityMetrics类别cbafcountsimQCcovRNADESeq2DEXSeqENmixFlowSorted.Blood.EPICGISPAGSRIIHWpapermetaseqR2methylCCmethylumiminfiMLInterfacesmogsaNBAMSeqNxtIRFcorepcaExplorerPECAphenoTestprotGearpwrEWAS林格RNAinteractMAPKspatialHeatmaptilingArrayXDEzinbwave
建议我 注释生命网络BloodCancerMultiOmics2017categoryCompareClassifyRclusterStabcodelink可乐compcodeRcuratedBladderDatacuratedCRCDatacuratedOvarianDataDelayedArrayEnrichedHeatmapfactDesignffpeffpeExampleDatagageDataGenoGAMGenomicFilesGOstatsGSARGSEAlmGSVAlogicFS光民MAQCsubsetMMUPHinnpGSEA益生元phyloseqpvacqpgraphRforProteomicsrheumaticConditionWOLLBOLDrtracklayersiggenessimplifyEnrichmentSingle.mTEC.TranscriptomesTCGAbiolinkstopGO
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 genefilter_1.78.0.tar.gz
Windows二进制 genefilter_1.78.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) genefilter_1.78.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefilter
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ genfilter
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/
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