genefilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.genefilter

基因过滤器:从高通量实验中过滤基因的方法

Bioconductor版本:Release (3.15)

筛选基因的一些基本功能。

作者:Robert Gentleman, Vincent J. Carey, Wolfgang Huber, Florian Hahne

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“genefilter”)

PDF	R脚本	使用基因过滤器功能从微阵列数据集中过滤基因
PDF	R脚本	02 -如何找到表达谱与指定基因相似的基因
PDF	R脚本	03 -额外的图:独立过滤增加了检测差异表达基因的能力，Bourgon等人，PNAS (2010)
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.78.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 17年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	BiocGenerics，AnnotationDbi，注释，Biobase，图形，方法，统计，生存, grDevices
链接
建议	类，hgu95av2.db，tkWidgets，所有，中华民国，RColorBrewer，BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	cellHTS2，CNTools，GeneMeta，Hiiragi2013，maEndToEnd，rnaseqGene，SISPA，股东价值分析
进口我	a4Base，annmap，arrayQualityMetrics，类别，cbaf，countsimQC，covRNA，DESeq2，DEXSeq，ENmix，FlowSorted.Blood.EPIC，GISPA，GSRI，IHWpaper，metaseqR2，methylCC，methylumi，minfi，MLInterfaces，mogsa，NBAMSeq，NxtIRFcore，pcaExplorer，PECA，phenoTest，protGear，pwrEWAS，林格，RNAinteractMAPK，spatialHeatmap，tilingArray，XDE，zinbwave
建议我	注释，生命网络，BloodCancerMultiOmics2017，categoryCompare，ClassifyR，clusterStab，codelink，可乐，compcodeR，curatedBladderData，curatedCRCData，curatedOvarianData，DelayedArray，EnrichedHeatmap，factDesign，ffpe，ffpeExampleData，gageData，GenoGAM，GenomicFiles，GOstats，GSAR，GSEAlm，GSVA，logicFS，光民，MAQCsubset，MMUPHin，npGSEA，益生元，phyloseq，pvac，qpgraph，RforProteomics，rheumaticConditionWOLLBOLD，rtracklayer，siggenes，simplifyEnrichment，Single.mTEC.Transcriptomes，TCGAbiolinks，topGO
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	genefilter_1.78.0.tar.gz
Windows二进制	genefilter_1.78.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	genefilter_1.78.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefilter
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ genfilter
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/
软件包下载报告	下载数据