代理商

doi:10.18129/b9.bioc.generxcluster

GRX差异聚类

生物导体版本:版本(3.15)

检测基因组位点的差异聚类,例如基因治疗整合。该软件包提供了一些探索来自两个不同来源的基因组插入位点的功能。可能,这两个来源是两个不同的基因疗法载体。对向量的优选,目标敏感区域的频率较低,从而激发了搜索局部插入簇的搜索以及通过集成不同向量形成的群集的比较。扫描统计数据允许在错误发现率(FDR)(FDR)中发现空间差异,从而提供用于比较逆转录病毒载体的统计方法。这里实现了使用多个窗口宽度来检测聚类差异和计算FDR的两个向量的扫描统计量。

作者:查尔斯·贝瑞(Charles Berry)

维护者:Charles Berry

引用(从r内,输入引用(“代理商”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ generxcluster”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“代理”)

PDF R脚本 使用代代cl
PDF 参考手册

细节

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版本 1.32.0
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(8年)
执照 GPL(> = 2)
要看 基因组机,,,,iranges
进口
链接
建议 运行,,,,生物基因
系统要求
增强
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取决于我
进口我
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构建报告

包装档案

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源包 GenerxCluster_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 GenerxCluster_1.32.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) GenerxCluster_1.32.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/generxcluster
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/generxcluster
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/generxcluster/
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