geNetClassifier

DOI:10.18129 / B9.bioc.geNetClassifier

疾病分类和构建基因网络使用相关基因表达谱

Bioconductor版本:版本(3.13)

综合方案自动训练和验证一个多层次SVM分类器基于基因表达数据。提供透明的选择的基因标记,coexpression网络,查询分类器的接口。

作者:Sara Aibar,西莉亚Fontanillo和哈维尔·De Las里瓦斯。生物信息学与功能基因组学。癌症研究中心(CiC-IBMCC CSIC / USAL)。萨拉曼卡。西班牙。

维护人员:莎拉Aibar < saibar在usal.es >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“geNetClassifier”)

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文档

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PDF	R脚本	geNetClassifier-vignette
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细节

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版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(8年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10.1),Biobase(> = 2.5.5),EBarrays,minet、方法
进口	e1071、图形grDevices
链接
建议	leukemiasEset,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了	RColorBrewer,igraph,infotheo
URL	http://www.cicancer.org
取决于我
进口我	bioCancer,癌症
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	geNetClassifier_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	geNetClassifier_1.32.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	geNetClassifier_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geNetClassifier
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ geNetClassifier
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/geNetClassifier/
包下载报告	下载数据