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- Bioconductor 3.13
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- gcapc
gcapc
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DOI:10.18129 / B9.bioc.gcapc
GC调用者知道峰
Bioconductor版本:版本(3.13)
呼吁ChIP-seq峰值数据考虑潜在的测序读GC的偏见。GC的偏见是第一次估计广义线性混合模型使用有效的GC策略,然后应用到峰值估计意义。
作者:Mingxiang腾和拉斐尔·a·伊
维护人员:Mingxiang腾< tengmx gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“gcapc”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“gcapc”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“gcapc”)
| HTML | R脚本 | gcapc用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.16.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(4年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.4) |
| 进口 | BiocGenerics,GenomeInfoDb,S4Vectors,IRanges,Biostrings,BSgenome,GenomicRanges,Rsamtools,GenomicAlignments,matrixStats,质量样条函数,grDevices、图形、数据、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/tengmx/gcapc |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | epigraHMM |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | gcapc_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gcapc_1.16.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | gcapc_1.16.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gcapc |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gcapc |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gcapc/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
