gaga

DOI:10.18129 / B9.bioc.gaga

用于高通量数据分析的GaGa层次模型

Bioconductor版本:发行版(3.16)

实现GaGa模型进行高通量数据分析,包括差异表达分析、监督基因聚类和分类。此外,它使用GaGa和LNNGV模型(后者来自EBarrays包)执行顺序样本量计算。

作者:David Rossell

维护者:David Rossell

引文(从R内,输入引用(“嘎嘎”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("gaga")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“嘎嘎”)

PDF R脚本 gaga图书馆手册
PDF 参考手册

细节

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版本 2.44.0
在Bioconductor BioC 2.2 (R-2.7)(14.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.8.0),Biobase,coda,EBarrays,mgcv
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了 平行
URL
全靠我
进口我 卡斯珀
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 gaga_2.44.0.tar.gz
Windows二进制 gaga_2.44.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) gaga_2.44.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) gaga_2.44.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gaga
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gaga
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/gaga/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/gaga/
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