funtooNorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.funtooNorm

标准化程序英飞纳姆HumanMethylation450 BeadChip工具包

Bioconductor版本:版本(3.15)

提供了一个功能正常化Illumina公司英人类甲基化450 BeadChip (Illumina公司450 k),纠正组织和/或细胞类型。

作者:西莉亚Greenwood <西莉亚。格林伍德在麦吉尔。ca >,斯捷潘Grinek <斯捷潘。grinek ladydavis。ca >,马克西姆鲟鳇鱼<马克西姆。在mail.mcgill鲟鳇鱼。ca >,凯瑟琳·克莱因<凯萨琳。克莱恩在mail.mcgill.ca >

维修工:凯萨琳克莱因<凯萨琳。克莱恩在mail.mcgill.ca >

从内部引用(R,回车引用(“funtooNorm”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“funtooNorm”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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细节

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版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.4)
进口 ,matrixStats,minfi、方法、IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,GenomeInfoDbgrDevices图形,统计数据
链接
建议 prettydoc,minfiData,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 funtooNorm_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 funtooNorm_1.20.0.zip(64位)
macOS 10.13(高山脉) funtooNorm_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/funtooNorm
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ funtooNorm
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/funtooNorm/
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