生物导体版本:版本(3.15)
FMCSR软件包引入了一种有效的最大公共结构(MCS)算法,并结合了一种新型的匹配策略,该策略允许在两个小分子中共享的子结构中进行原子和/或键不匹配。所得的柔性MCS(FMCSS)通常比严格的MCS大,从而鉴定出其源结构中更常见的特征,并且在寻找具有较弱结构相似性的化合物时具有更高的灵敏度。FMCSR软件包提供了多个实用程序,用于使用FMCS算法进行成对化合物比较,结构相似性搜索和聚类。
作者:Yan Wang,Tyler Backman,Kevin Horan,Thomas Girke
维护者:thomas girke
引用(从r内,输入引用(“ FMCSR”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ FMCSR”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ FMCSR”)
html | R脚本 | FMCSR |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 |
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版本 | 1.38.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(9。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.10.0),化学机器, 方法 |
进口 | 运行, 方法,化学机器,,,,生物基因, 平行 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,编织,,,,Knitrbootstrap,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/girke-lab/fmcsr |
取决于我 | |
进口我 | chemodiv |
建议我 | 化学机器 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | fmcsr_1.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | FMCSR_1.38.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | fmcsr_1.38.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fmcsr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/fmcsr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/fmcsr/ |
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