FMCSR

doi:10.18129/b9.bioc.fmcsr

不匹配的最大公共子结构搜索不匹配

生物导体版本:版本(3.15)

FMCSR软件包引入了一种有效的最大公共结构(MCS)算法,并结合了一种新型的匹配策略,该策略允许在两个小分子中共享的子结构中进行原子和/或键不匹配。所得的柔性MCS(FMCSS)通常比严格的MCS大,从而鉴定出其源结构中更常见的特征,并且在寻找具有较弱结构相似性的化合物时具有更高的灵敏度。FMCSR软件包提供了多个实用程序,用于使用FMCS算法进行成对化合物比较,结构相似性搜索和聚类。

作者:Yan Wang,Tyler Backman,Kevin Horan,Thomas Girke

维护者:thomas girke

引用(从r内,输入引用(“ FMCSR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ FMCSR”)

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文档

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Browsevignettes(“ FMCSR”)

html R脚本 FMCSR
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版本 1.38.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(9。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.10.0),化学机器, 方法
进口 运行, 方法,化学机器,,,,生物基因, 平行
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,编织,,,,Knitrbootstrap,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/girke-lab/fmcsr
取决于我
进口我 chemodiv
建议我 化学机器
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 fmcsr_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 FMCSR_1.38.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) fmcsr_1.38.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fmcsr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/fmcsr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/fmcsr/
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