flowSpecs

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowSpecs

高维血细胞计数数据的工具进行处理

Bioconductor版本:版本(3.15)

这个包是为了填补传统的角色血细胞计数预处理软件,谱分解、转换、可视化和清理,并援助下游分析,与服饰等,通过启用flowFrames转型和flowSets dataframes。函数flowCore-compliant自动1 d-gating /过滤管道。包的名称选择将处理光谱血细胞计数,这将有希望给用户一个很好的副眼镜通过查看他们的数据。

作者:Jakob Theorell (aut (cre)

维护人员:Jakob Theorell <雅克布。在ndcn.ox.ac.uk theorell >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“flowSpecs”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“flowSpecs”)

HTML	R脚本	原始光谱血细胞计数文件的示例工作流进行处理
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文本		许可证

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0)
进口	ggplot2(> = 3.1.0),BiocGenerics(> = 0.30.0),BiocParallel(> = 1.18.1),Biobase(> = 2.48.0),reshape2(> = 3),flowCore(> = 1.50.0),动物园(> = 1.8.6),数据(> = 3.6.0)、方法(> = 3.6.0),hexbin(> = 1.28.2)
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,服饰
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/jtheorell/flowSpecs/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	flowSpecs_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	flowSpecs_1.10.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	flowSpecs_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowSpecs
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ flowSpecs
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowSpecs/
包下载报告	下载数据