ffpe

DOI:10.18129 / B9.bioc.ffpe

FFPE芯片表达数据的质量评估与控制

Bioconductor版本:发行版(3.16)

使用为来自福尔马林固定、石蜡嵌入(FFPE)数据的表达数据开发的指标识别低质量数据。也是一个功能,使和谐在顶部地块(cat地块)。

作者:Levi Waldron

维护者:Levi Waldron 上搜索

引文(从R内,输入引用(“ffpe”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ffpe”)

PDF R脚本 Ffpe包使用指南
PDF 参考手册

细节

biocViews bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.42.0
在Bioconductor BioC 2.10 (R-2.15)(11年)
许可证 GPL (> 2)
取决于 R (>= 2.10.0),竞技场队伍、方法
进口 BiobaseBiocGenericsaffy光民methylumisfsmisc
链接
建议 genefilterffpeExampleData
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ffpe_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 ffpe_1.42.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) ffpe_1.42.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) ffpe_1.42.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ffpe
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ffpe
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ffpe/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ffpe/
软件包下载报告 下载数据

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支持»

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