fcScan

DOI:10.18129 / B9.bioc.fcScan

fsccan用于检测用户定义选项的坐标集群

Bioconductor版本:发行版(3.13)

该包用于检测落在用户定义的窗口大小内的基因组坐标组合,以及用户定义的已识别的相邻簇之间的重叠。它可以用于基因组数据,其中簇建立在特定染色体或特定链上。集群可以使用“贪婪”选项执行,允许在允许的窗口大小内出现额外的站点。

作者:Abdullah El-Kurdi Ghiwa khalil Georges Khazen Pierre Khoueiry

维护者:Pierre Khoueiry Abdullah El-Kurdi

引文(从R内,输入引用(“fcScan”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" fsccan ")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“fcScan”)

超文本标记语言 R脚本 fcScan
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

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版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 统计数据,plyrVariantAnnotationSummarizedExperimentrtracklayerGenomicRanges、方法、IRanges
链接
建议 RUnitBiocGenericsBiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 fcScan_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 fcScan_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) fcScan_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fcScan
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ fsccan
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/fcScan/
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