fabia。

DOI:10.18129 / B9.bioc.fabia

FABIA:双簇采集的因子分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

“双簇获取因子分析”(FABIA)中的双簇。FABIA是一种基于模型的双集群技术，即同时对行和列进行集群。通过因子分析，在因子和加载矩阵都是稀疏的情况下，发现了双簇。FABIA是一个乘法模型，提取样本和特征模式之间的线性依赖关系。它捕获在基因表达测量中观察到的具有重尾的现实非高斯数据分布。FABIA利用了众所周知的模型选择技术，如EM算法和变分方法，并嵌入到贝叶斯框架中。FABIA根据它们的信息含量对团簇进行排名，并将假团簇与真团簇分开。代码是用C语言编写的。

作者:Sepp Hochreiter

维护者:Andreas Mitterecker < Mitterecker at bioinf.jku.at>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“fabia。”)

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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	2.44.0
在Bioconductor	BioC 2.7 (R-2.12)(12.5年)
许可证	LGPL (>= 2.1)
取决于	R (>= 3.6.0)，Biobase
进口	方法，图形，grDevices，统计，utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinf.jku.at/software/fabia/fabia.html
全靠我	hapFabia
进口我	miRSM，mosbi
建议我	fabiaData
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	fabia_2.44.0.tar.gz
Windows二进制	fabia_2.44.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	fabia_2.44.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	fabia_2.44.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fabia
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/fabia
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/fabia/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/fabia/
软件包下载报告	下载数据