esetVis

DOI:10.18129 / B9.bioc.esetVis

的可视化expressionSet Bioconductor对象

Bioconductor版本:版本(3.13)

效用函数的可视化expressionSet(或SummarizedExperiment) Bioconductor对象,包括光谱图、tsne和线性判别分析。静态图通过ggplot2包或互动通过ggvis rbokeh包是可用的。

作者:罗兰Cougnaud <罗兰。在openanalytics.eu cougnaud >

Laure Cougnaud维护者:<罗兰。在openanalytics.eu cougnaud >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“esetVis”)

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文档

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browseVignettes (“esetVis”)

HTML	R脚本	esetVis包
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	mpm,hexbin,Rtsne,中长期规划、网格Biobase,质量统计,跑龙套,grDevices方法
链接
建议	ggplot2,ggvisrbokeh,ggrepel,knitr,rmarkdown,所有,hgu95av2.db,AnnotationDbi,老鸨,SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	esetVis_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	esetVis_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	esetVis_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/esetVis
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ esetVis
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/esetVis/
包下载报告	下载数据