逃避
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DOI:10.18129 / B9.bioc.escape
简单的单细胞分析平台富集
Bioconductor版本:发布(3.15)
一个桥接R包，以促进基因集富集分析(GSEA)在单细胞RNA测序的背景下。使用原始计数信息、Seurat对象或singlecellexexperiment格式，用户可以跨单个单元执行和可视化GSEA。
作者:Nick Borcherding [aut, cre]， Jared Andrews [aut]
维护者:Nick Borcherding
引用(来自R，输入引用(“逃离”)）:
安装
要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("escape")
对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:
browseVignettes(“逃离”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | Escape-ingToWork |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor中 | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | grDevices,dplyr，ggplot2，GSEABase，GSVA，SingleCellExperiment，ggridges，msigdbr统计数据,BiocParallel，矩阵，UCell，扫帚，reshape2，拼接而成，MatrixGenerics跑龙套,rlang，stringr，data.table，SummarizedExperiment、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 修拉，SeuratObject，knitr，rmarkdown，减价，BiocStyle，testthat，dittoSeq(> = 1.1.2) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 这取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | Cepo |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。
| 源包 | escape_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | escape_1.6.0.zip(64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | escape_1.6.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/escape |
| 源存储库(开发人员访问) | Git clone git@git.bioconductor.org:packages/escape |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/escape/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
