生物导体版本:版本(3.15)
该软件包提供了使用Epiviz Web组件对基因组数据进行交互式可视化的API。R/Bioconductor中的对象可用于生成交互式R Markdown/Notebook文档,也可以在R Studio的默认查看器中可视化。
作者:Brian Gottfried [AUT],Jayaram Kancherla [AUT],Hector Corrada Bravo [AUT,CRE]
维护者:hector Corrada bravo
引用(从r内,输入引用(“ epivizrchart”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Epivizrchart”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ epivizrchart”)
html | R脚本 | Epivizrchart简介 |
html | R脚本 | 使用Epivizrchart可视化`rangesummarizedExperiment`对象闪亮的应用程序 |
html | R脚本 | 用epivizrchart可视化文件 |
html | R脚本 | 使用EpivizRchart可视化闪亮应用中的基因组数据 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(4。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.5.0) |
进口 | epivizrdata(> = 1.5.1),Epivizrserver,,,,htmltools,,,,rjson, 方法,生物基因 |
链接 | |
建议 | 测试,,,,roxygen2,,,,尼特,,,,生物酶,,,,基因组机,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,总结性特征,,,,抗fofilesdata,,,,hgu133plus2.db,,,,mus.musculus,,,,生物使用,,,,同性恋,,,,闪亮的,,,,Minfi,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,rcolorbrewer,,,,马格里特,,,,AnnotationHub |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | epivizrchart_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | epivizrchart_1.18.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | epivizrchart_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrchart |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/epivizrchart |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/epivizrchart/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |