epistack

DOI:10.18129 / B9.bioc.epistack

来自表观遗传信号的堆栈剖面热图

Bioconductor版本:发行版(3.16)

书信体包的主要目标是基因组轨迹堆栈的可视化(如,但不限于,ChIP-seq, ATAC-seq, DNA甲基化或基因组守恒数据)集中在感兴趣的基因组区域。

作者:SACI Safia [aut], DEVAILLY Guillaume [cre]

维护者:DEVAILLY Guillaume

引文(从R内,输入引用(“epistack”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“epistack”)

超文本标记语言 R脚本 使用epistack
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

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版本 1.4.0
在Bioconductor bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 4.1)
进口 GenomicRangesSummarizedExperimentBiocGenericsS4VectorsIRangesviridisLite、图形、plotrix, grDevices,统计,方法
链接
建议 testthat(> = 3.0.0),BiocStyleknitrrmarkdownEnrichedHeatmapbiomaRtrtracklayercovrvdiffr魔法
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 epistack_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 epistack_1.4.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) epistack_1.4.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) epistack_1.4.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epistack
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/epistack
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/epistack/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/epistack/
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