Epgenomix
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doi：10.18129/b9.bioc.pepigenomix
表观遗传和基因转录数据归一化以及与混合模型的整合
生物导体版本：版本（3.15）
通过CHIP-SEQ获得的基于RNA-SEQ或微阵列基因转录和组蛋白修饰数据的集成分析的包装。该软件包提供了用于数据预处理和匹配的方法以及适合贝叶斯混合模型的方法，以检测两种数据类型差异的基因。
作者：汉斯·乌尔里希·克莱因（Hans-Ulrich Klein），马丁·谢弗（Martin Schaefer）
维护者：hans-ulrich klein
引用（从r内，输入引用（“ Epegenomix”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Epigenomix”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Epegenomix”）
| R脚本 | Epigenomix软件包小插图 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.36.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（9。5年） |
| 执照 | LGPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），方法，生物酶，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，总结性特征 |
| 进口 | 生物基因，，，，MCMCPACK，，，，rsamtools， 平行，GenomeInfodB，，，，Beadarray |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | epigenomix_1.36.0.tar.gz |
| Windows二进制 | epigenomix_1.36.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | Epigenomix_1.36.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epigenomix |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/epgenomix |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/epigenomix/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
